《浪客剑心》分集剧情介绍第1-95全集大结局

　　天草长伍和村民们被捕入狱，政府打算流放村民并处决天草，在剑心和艾司登先生的极力劝阻并以利害关系相陈之后，政府官员经过协商，决定将他们驱逐出境，艾司登决定派船接他们去荷兰，那里是天主教徒的天堂，他们会在那里开始新的生活，而艾司登亦得以完成玛莉娜小姐的嘱托。临行前，神谷熏去监狱探望天草，并将佐之助交给她的玛莉娜的那封遗书给天草看，谈话间，阿熏深深体会到他失去最心爱的人的痛苦，也觉察到他内心的善良，而天草也决定不再用剑，而是用一颗炽热的心去保护身边的人。

　　佐之助来到玛莉娜的墓前，又陷入痛苦的追忆中，后来他遇见庄三（竟然还没死），佐之助又为自己未能实践保护玛莉娜的诺言而内疚，不过两人都为玛莉娜能最终达成遗愿而欣慰。

　　最后，剑心，阿熏，佐之助等与天草和村民们在码头一一道别，并目送他们踏上新的旅程。 　神谷道场门下又多了一个弟子，那就是由太郎。他自幼父母双亡，与一位德国的医学博士亨仕相依为命，博士待他像亲身儿子一样，而由太郎亦下决心要刻苦钻研医学，救助有需要的人。

　　但有一天，博士却把由太郎带到东京，刚到步，由太郎便弄伤了手腕，博士两下工夫就把伤口包扎好，更令由太郎佩服不已，然后，博士带由太郎到神谷道场，希望由太郎能寄居一段时间，自己要去办点事，由太郎顺理成章地成为了阿熏的二弟子，他和弥彦立刻成为小冤家，争吵不休，道场顿时热闹非凡，唯独剑心觉得博士的神情有些异样。恰逢元宵节，众人去看焰火，而博士也带由太郎回去了，剑心不大放心，于是尾随两人，果然，途中数名德国皇家警备团的剑客，剑上有特殊辉章，拦住去路，要博士将什么圣药的秘药的配方交出来，博士不丛，众剑客打伤博士，并在他身上拿走了一张纸，由太郎见博士倒地，不顾一切要和众剑客同归于尽，剑心见事态严重，出手相助。那些剑客个个身手不凡，几个回合后，他们见目的已达到，便撤退了。剑客们后来开庆祝会庆祝行动成功，不料一名神秘的女忍者忽然出现，要求他们交出配方，双方剑拔弩张……一场暴风雨即将来临。

　　亨仕博士遇袭伤重昏迷，危在旦夕。元斋和阿惠全力抢救。众人从博士交给由太郎保存的那本日记中了解到一些关于圣药的灵药的事。数十年前，博士到日本留学，当时日本的传教活动几乎已绝迹，他偶然遇到一位传教士，传教士将这本神秘的书籍交给他，上面记载了圣药的灵药的埋藏地。可惜全部都是暗语，传教士希望他能解开这个谜。所谓灵药，是居住在日本的先祖们研制出来的一种长生不老药，由一个叫真田的忍者部族世代守护。经过研究有关文献，博士发现灵药是一种高效的抗生素类药，当时病毒和传染病正在全世界流行。因此若能大量生产这种药，必能造福人间，实现博士多年的夙愿。偏偏一个罪恶的集团--黑骑士团亦对此虎视眈眈。黑骑士团是欧洲中世纪的由一些武士，商人，政客组成的集团，他们大多是对现实不满的社会精英。他们希望拿到灵药的配方，大量贩卖灵药赚钱，并以此作为资本实现他们统治世界的目的。