《旗舰》分集介绍（1-34全集）大结局

　　基地司令陈敬国亲自来到军港，嘉奖180舰的勇敢行动，并向军港告别，他将上调东方舰队任副司令，临行前他嘱咐儿子陈建军抓紧学习，迎接舰长的竞争。

　　沮丧无奈的郑远海把一切不满发泄在猪的身上，姜喜子严肃地谴责他这是损害军事财产，搞得郑远海哭笑不得。

　　心仪郑远海的秦思婷探亲回到中南市，顺便来到了郑远海家探望他的母亲许欣芳，在那里见到了也来探望的于季东。于季东对秦思婷情有独钟，他高兴的请秦思婷吃饭。

　　谢庭群来到猪场，向郑远海讲述了自己第一次出海的感受，更激起郑远海上舰的欲望。晚上，姜喜子给郑远海讲述了一个老兵坚守理想的故事，使他似乎悟道了鲁淮成让他到猪场是励练自己意志的真正意图，开始静心地搞起了科学养猪。

　　鲁淮成看到了郑远海进步，开始了第二步对他的考察，让他带队到深山里维护军事通讯线路的畅通，并不准带钱和干粮，考验他野外生存的能力。

《旗舰》分集介绍：第四集

　　郑远海的护线小组沿着军用线路在深山中行进，几天下来，负责伙食的姜喜子用聪明才智使大家吃着野菜野果，喝着是山泉小溪，包括烤熟的大蚂蚁。虽苦但没饿着。这天，姜喜子在山里发现了一头山羊，战士们高兴坏了，但郑远海严令不准把它弄死，要等老百姓上山来找。这下可把大家馋死了，他们只能拉着这头羊继续巡逻。

　　终于在一个悬崖边，山羊失足掉到了山涧摔死了，郑远海只得下令把山羊烤着吃了。大家欣喜若狂的刚吃完烤羊，一个小姑娘站在了郑远海身边，她坚持说这羊是她家的，要索赔。这下难坏了郑远海，他好言相说没钱，等护线任务结束了一定加倍偿还，但小姑娘说什么也不行，最后她哭着而去。

　　一天清晨，郑远海在丛林巡逻中，看见一个小伙子在欺负那个小姑娘，他赶上去一顿爆打，小姑娘赶紧拉住，说是自己的男朋友，郑远海惊讶地停住手，小伙子连滚带爬地逃下山。

　　郑远海后来才弄清，这个小姑娘叫梅杏儿，在县成上高中，放假回来帮她爹放羊，顺便复习功课，准备明年的高考，那个小伙子叫柱子，她爹为了供她上学，找柱子家借了钱，并承诺把梅杏儿将来嫁给柱子。郑远海惊讶地看着梅杏儿，告诉她这事要自己做主。并劝她报考军校，这样很多费用可以国家负担。梅杏儿感激地看着这个解放军大哥。

　　基地为了考核陈建军，专门安排他以舰长身份指挥一次实弹演习，谢庭群为了巴结陈建军，从基地作战处的一个老乡处打听到了标靶的位置，悄悄地告诉了他，结果陈建军准确无误地击中目标。但最后陈建军诚实地告诉了鲁淮成，自己这次打靶算作弊，请求处分。鲁淮成其实心中有数，就看陈建军能不能自己承认错误，现在他不但没有给他处分，而且同意送他到舰艇学院参加舰副长班的学习。

　　郑远海很好地完成野外护线任务，当鲁淮成来接他们的时候，看见了送行的梅杏儿，他仿佛看见了自己丢失了十多年的女儿。

《旗舰》分集介绍：第五集

　　鲁淮成给陈建军下达命令，在上学之前，完成对海风导弹的自动化指挥控制系统。陈建军觉得自己解决这个问题难度太大，他想到了大学生郑远海，于是，郑远海兴奋地来到了自己朝思慕想的舰艇上。